Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RabggtbP53612 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RabggtbP53612 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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