Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
FmodP50608 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FmodP50608 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FmodP50608 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
FmodP50608 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
FmodP50608 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FmodP50608 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms