Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpdP50404 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms