Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxc13P50207 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxc13P50207 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms