Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptx3P48759 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms