Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcd1P48410 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms