Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx2P48379 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rfx2P48379 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms