Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf1P46099 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf1P46099 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf1P46099 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf1P46099 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf1P46099 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf1P46099 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf1P46099 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms