Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ThpoP40226 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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