Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cap1P40124 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cap1P40124 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms