Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ddit3P35639 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ddit3P35639 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms