Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ly6dP35459 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms