Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab20P35295 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab20P35295 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms