Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apoc1P34928 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apoc1P34928 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms