Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SsbP32067 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SsbP32067 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SsbP32067 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SsbP32067 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SsbP32067 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms