Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cdk4P30285 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk4P30285 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms