Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprmP28828 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprmP28828 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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