Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif5cP28738 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms