Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn10P28658 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn10P28658 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms