Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms