Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psmb9P28076 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms