Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Lef1P27782 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Lef1P27782 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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