Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pde6aP27664 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pde6aP27664 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6aP27664 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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