Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
U2af2P26369 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms