Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nfkb1P25799 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nfkb1P25799 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms