Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xrcc6P23475 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms