Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ggta1P23336 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms