Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrkchP23298 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrkchP23298 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms