Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PparaP23204 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PparaP23204 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PparaP23204 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PparaP23204 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PparaP23204 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms