Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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