Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TP20293 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TP20293 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TP20293 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TP20293 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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