Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VimP20152 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VimP20152 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VimP20152 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VimP20152 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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