Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl13aP19253 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms