Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P18528 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P18528 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P18528 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
P18528 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
P18528 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P18528 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms