Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ass1P16460 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms