Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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