Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RhoP15409 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RhoP15409 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RhoP15409 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms