Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb1P13372 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms