Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Calb1P12658 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms