Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lamp1P11438 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms