Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxd4P10628 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms