Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccl2P10148 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ccl2P10148 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ccl2P10148 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ccl2P10148 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ccl2P10148 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ccl2P10148 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccl2P10148 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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