Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Becn2P0DM65 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Becn2P0DM65 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms