Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Hoxa5P09021 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms