Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Col4a2P08122 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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