Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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TtrP07309 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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TtrP07309 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TtrP07309 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TtrP07309 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TtrP07309 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TtrP07309 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TtrP07309 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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TtrP07309 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TtrP07309 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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