Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnfP06804 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnfP06804 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnfP06804 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms