Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcb1bP06795 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1bP06795 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1bP06795 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1bP06795 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1bP06795 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms