Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfrbP05622 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms