Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-Eb1P04230 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-Eb1P04230 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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